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ECD/UV计算-ORCA ECD/UV计算-ORCA
【殷赋云教程】ECD/UV计算-ORCA 1. 前言 电子圆二色谱/紫外光谱(ECD/UV)计算已成为辅助确证化合物绝对构型的常用手段。本期教程以一个简单的例子,介绍如何使用殷赋云平台的方案工具进行ECD/UV计算。 本次使用的方案是
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ECD/UV计算 ECD/UV计算
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ECD/UV计算 ECD/UV计算
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含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(Vina) 含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(Vina)
【殷赋云教程】含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(Vina) 1. 前言 本教程讲述如何使用殷赋云平台的【小分子虚拟筛选(Vina)】方案和相关小工具,对大型化合物库进行小分子苗头化合物的虚拟筛选。 2. 流程图 graph LR A(准
含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(DOCK 6.9) 含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(DOCK 6.9)
【殷赋云教程】含共晶配体蛋白的小分子虚拟筛选(DOCK 6.9) 1. 前言 本教程讲述如何使用殷赋云平台的【小分子虚拟筛选(DOCK 6.9)】和【准备化合物库】大方案,以含共晶配体的蛋白为靶标,对自备化合物库进行小分子苗头化合物的虚
蛋白与小分子的分子动力学模拟(隐式溶剂) 蛋白与小分子的分子动力学模拟(隐式溶剂)
【殷赋云教程】蛋白与小分子的分子动力学模拟(隐式溶剂) 1. 前言 分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟技术的一个广泛应用是研究蛋白与小分子之间的相互作用。本教程讲述如何使用殷赋云平台的大方案和小工具,实现蛋白
蛋白与小分子的分子动力学模拟(显式溶剂) 蛋白与小分子的分子动力学模拟(显式溶剂)
【殷赋云教程】蛋白与小分子的分子动力学模拟(显式溶剂) 1. 前言 分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟技术的一个广泛应用是研究蛋白与小分子之间的相互作用。本教程讲述如何使用殷赋云平台的大方案和小工具,实现蛋白
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蛋白与多肽的对接计算教程 蛋白与多肽的对接计算教程
【殷赋云教程】蛋白与多肽的对接计算教程 1. 前言 本教程讲述如何使用CABS-dock网站、殷赋云平台分子动力学方案及相关小工具,实现蛋白与多肽的对 接计算。 本次示例中,受体蛋白分别为3BP1(PDB ID : 1ABO),配体多肽
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