用计算擘画未来
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提取量化数据 提取量化数据
1. 用途 从量化计算主流程序(包括Gaussian、ORCA、GAMESS-US和NWChem)的输出文件中提取基本数据,如:电子能量、振动频率、原子坐标。发表文章用到量化计算时,通常需要在支持信息(Supporting Informa
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量化计算(ORCA 4.2) 量化计算(ORCA 4.2)
1. 用途 采用ORCA 4.2程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括:单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、红外(IR)和拉曼光谱(Raman)计算。 2. 入口 平台地址:https://cloud.yinfotek
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量化计算 Gaussian 09 量化计算 Gaussian 09
1. 用途 采用Gaussian 09程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括:单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、比旋光度计算。 2. 入口 平台地址:https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口:
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准备Amber文件 准备Amber文件
1. 用途 为Amber分子动力学模拟准备所需的拓扑和坐标文件。支持生物大分子、有机小分子体系,暂不支持膜蛋白。 2. 预备知识 2.1 溶剂模型 通常研究的有机生物体系是在溶液(尤其是水溶液)中进行的,水对蛋白折叠、热力学性质有着极
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