1. 用途 采用ORCA 4.2程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括：单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、红外（IR）和拉曼光谱（Raman）计算。 2. 入口 平台地址：https://cloud.yinfotek

1. 用途 采用Gaussian 09程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括：单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、比旋光度计算。 2. 入口 平台地址：https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口：

1. 用途 为Amber分子动力学模拟准备所需的拓扑和坐标文件。支持生物大分子、有机小分子体系，暂不支持膜蛋白。 2. 预备知识 2.1 溶剂模型 通常研究的有机生物体系是在溶液（尤其是水溶液）中进行的，水对蛋白折叠、热力学性质有着极

1. 用途 为有机小分子添加原子电荷，并检查是否存在Amber GAFF力场所没有的拓扑参数。本工具提供两种计算电荷的方法——RESP拟合静电势和AM1-BCC。 2. 预备知识 2.1 原子电荷 原子电荷是用点电荷形式描述化学体系电

1. 用途 采用GHECOM等算法识别蛋白质/核酸中潜在的小分子结合位点，输出文件可用于分子对接定义口袋。 2. 入口 平台地址：https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口：左侧菜单栏【计算方案】->【小工具

1. 用途 从Uniprot和RCSB PDB数据库中搜索蛋白记录，获取PDB结构。 2. 入口 平台地址：https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口：左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构

1. 用途 从PubChem和ZINC 15等数据库搜索化合物结构。 2. 入口 平台左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【搜索化合物】 3. 步骤 输入化合物名称、CAS号、PubChem

1. 用途 从氨基酸序列生成三维结构，或上传多肽分子文件，进行能量优化，获得良好的三维结构。 注意：本功能不涉及二级结构预测，但可用该三维结构做进一步模拟计算（如，分子动力学模拟），获得二级结构。 2. 入口 平台左侧菜单栏【计算方

1. 用途 为化合物添加氢原子、偏电荷（partial charge）、生成良好的3D结构，为后续模拟计算提供初始结构。 2. 入口 平台左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【准备化合物结构】 3

1. 用途 处理生物大分子PDB结构：修复残基、添加氢原子、分离受体和配体（若有）、剔除多余结构（如：水分子、助溶剂）。 2. 入口 平台左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【处理PDB结构】 3