1. 前言 本教程讲述如何使用殷赋云平台的量化计算方案及相关小工具，计算化合物的HOMO-LUMO能级。 **商业软件版权说明：**Gaussian 09为商业软件，我司只提供计算资源与服务，不提供安装包和版权，请用户自觉遵守软件版权相

1. 前言 上一篇文章《【殷赋云教程】ECD/UV计算》》提到，计算的ECD图谱在250-275 nm附近缺少了一个科顿效应（Cotton Effect, CE）。本期教程将讲述如何优化图谱。 影响计算图谱的因素有很多，其中最大的是构象。

1. 前言 电子圆二色谱/紫外光谱（ECD/UV）计算已成为辅助确证化合物绝对构型的常用手段。本期教程以一个简单的例子，介绍如何使用殷赋云平台的方案工具进行ECD/UV计算。 本次使用的方案是ORCA方案，没有Gaussian版权的用户

1. 前言 电子圆二色谱/紫外光谱（ECD/UV）计算已成为辅助确证化合物绝对构型的常用手段。本期教程以一个简单的例子，介绍如何使用殷赋云平台的方案工具进行ECD/UV计算。 2. 流程图 graph LR A(准备结构) --> B(

1. 前言 本教程讲述如何使用殷赋云平台的【小分子虚拟筛选（Vina）】方案和相关小工具，对大型化合物库进行小分子苗头化合物的虚拟筛选。 2. 流程图 graph LR A(准备受体三维结构) --> B(虚拟筛选) B(虚拟筛选) -

1. 前言 本教程讲述如何使用殷赋云平台的【小分子虚拟筛选（DOCK 6.9）】和【准备化合物库】大方案，以含共晶配体的蛋白为靶标，对自备化合物库进行小分子苗头化合物的虚拟筛选。 2. 流程图 graph LR A(准备受体三维结构)

1. 前言 分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟技术的一个广泛应用是研究蛋白与小分子之间的相互作用。本教程讲述如何使用殷赋云平台的大方案和小工具，实现蛋白与小分子复合物的隐式溶剂分子动力学模拟。 **在模拟开始前

1. 前言 分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟技术的一个广泛应用是研究蛋白与小分子之间的相互作用。本教程讲述如何使用殷赋云平台的大方案和小工具，实现蛋白与小分子复合物的MD模拟。 在模拟开始前，须事先准备好两者

【殷赋云教程】蛋白与多肽的对接计算教程 1. 前言 本教程讲述如何使用CABS-dock网站、殷赋云平台分子动力学方案及相关小工具，实现蛋白与多肽的对 接计算。 本次示例中，受体蛋白分别为3BP1（PDB ID : 1ABO），配体多肽

1. 前言 本教程讲述如何使用ZDOCK分子对接软件、殷赋云平台分子动力学方案及相关小工具，实现蛋白与蛋白的对接计算。 本次示例中，受体蛋白与配体蛋白分别为CDK2（PDB ID : 3PY1）和Cyclin-A2（PDB ID : 1V