1. 用途
处理生物大分子PDB结构:修复残基、添加氢原子、分离受体和配体(若有)、剔除多余结构(如:水分子、助溶剂)。
2. 入口
平台左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【处理PDB结构】
3. 步骤
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输入PDB结构,有两种方式:
- 输入PDB ID;
- 上传PDB文件。
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点击【确定】;
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选择模型(构象);
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勾选需要剔除的链或残基,点击【删除】;
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(可选)勾选需要重新分配的残基,点击左右箭头进行切换
平台默认已将受体和配体的残基划分到左右方框,应根据实际情况进行调整。
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点击【准备】;
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下载分子结构文件。