用计算擘画未来
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处理PDB结构(进阶版) 处理PDB结构(进阶版)
1. 用途 检查并修复生物大分子PDB的结构问题,为分子对接、分子动力学模拟等计算提供良好的三维结构。 2. 预备知识 2. 1 PDB常见问题 大多数PDB文件或多或少存在着各种问题,在进行分子模拟时,首先需要修复这些问题,才能确保
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提取比旋光度 提取比旋光度
1. 用途 从量化计算输出文件中提取比旋光度数据。目前仅支持Gaussian 09的输出文件,格式为log或out。 2. 入口 平台地址:https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口:左侧菜单栏【计算方案】->
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NMR回归分析 NMR回归分析
1. 用途 将计算的核磁(NMR)数据与实验数据回归分析,判断化合物结构或相对构型。 2. 特色 本工具支持电子表格在线编辑功能,支持Excel数据复制粘贴,提供详细的统计数据,高亮显示偏差较大的原子,帮助用户分析结构,判断构型。 3
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ECD/UV作图 ECD/UV作图
1. 用途 在线定制图谱样式,制作出版级别的高质量ECD/UV图谱。 2. 入口 平台左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【波谱分析】->【ECD/UV作图】 3. 步骤 3.1 上传图谱数据文件 文件内容为各
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ECD/UV拟合 ECD/UV拟合
1. 用途 将计算的电子圆二色谱(ECD)/紫外光谱(UV)与实验图谱拟合、比较,判断化合物绝对构型。 2. 特色 本工具支持多批次处理,自动拟合曲线,手动调整参数,允许随意组合构象,帮助用户排除不合理结果,获得最佳图谱。 3. 预备
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光谱平滑滤波 光谱平滑滤波
1. 用途 未经处理的实验光谱常伴有大量噪音,本工具采用Savitzky-Golay(S-G)卷积平滑算法对光谱数据进行处理,可提高光谱的平滑性,降低噪音的干扰。本工具适用于电子圆二色谱(ECD)、紫外吸收(UV-Vis)、红外(IR)、
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小分子构象搜索 小分子构象搜索
1. 概述 研究分子构象对于了解化合物结构、反应机理、能量分布等方面非常重要,在ECD/NMR计算、过渡态搜索、活性构象生成等许多计算研究中,通常是必不可少的步骤。本方案提供3种构象搜索算法以应对各种类型的有机小分子化学结构:系统搜索(S
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